گروه تحقیقاتی تنظیم پاسخهای ایمنی

پیشرفت سریع در حوزه های مختلف علمی از جمله ایمونولوژی باعث شده است که داده های آزمایشگاهی و بالینی مربوط به سیستم ایمنی، شبکه ای از هزاران ملکول را تشکیل دهند که می توانند در پاسخهای ایمنی دخیل بوده و نهایتا منجر به پاسخهای متفاوت ایمنی شوند. درک رفتار دینامیک شبکه سیستم ایمنی از طریق بیولوژی سیستم ها امکان پذیر است، عنوان کلی Immunoinformatics زمینه جدیدی است که بر پایه استفاده از نرم افزارها در جهت درک کلی این حجم عظیم داده ها شکل گرفته است. ایمونوژنومیک (بررسی ژنهای مرتبط با سیستم ایمنی) و ایمونوپروتئومیک (بررسی پروتئینهای مرتبط با سیستم ایمنی) و یا اصطلاح ایمونومیک immunomics- بررسی همه ژنها و پروتئینهای سهیم در پاسخ ایمنی – مرتبط با این موضوع هستند. مثلا بررسی همزمان بیان RNA  چندهزار ژن با استفاده از مایکرواری در شرایط خاص پاسخ ایمنی و تحلیل داده های به دست آمده بدون کمک نرم افزارها امکان پذیر نیست. البته در عمل حوزه هائی که بیشتر به آنها توجه شده و نرم افزارهای آماده و پایگاههای داده های (database) متعددی دارند در زمینه پیش بینی اپی توپهای آنتی ژنی T , B و واکسیناسیون، آلرژنها و تکامل سیستم ایمنی است (لیستی از این پایگاهها در منبع ذکر شده قابل دسترسی است). متاسفانه نرم افزار آماده یا وبسایتی که بتواند حجم زیاد داده های مربوط به سایتوکاینها در نمونه های مختلف بالینی و آزمایشگاهی را به راحتی آنالیز کرده و فاکتورهای کلیدی را در اختیار ما بگذارد و رفتار سیستم را تحلیل کند فراهم نیست و باید با کمک متخصصین آمار و کمک گرفتن از نرم افزارهائی که برای موارد مشابه دیگری طراحی شده اند و همچنین مطالعه و بحث علمی در مورد یافته ها تا حدی به مقصود نزدیک شد. 

با اقتباسی از : Immunoinformatics: an integrated scenario, Immunology, 2010